腸道微生物群是存在人體腸道的微生物群體的總稱，其中包括了細菌、真菌、古菌以及原生物動植物（甚至病毒）等種類眾多的微生物。由于測序技術(shù)的提高，近二十年來，科學(xué)界越來越關(guān)注腸道微生物菌群。也有很多的證據(jù)表明，腸道微生物菌群對于人體的健康有著很大影響。這種影響不僅局限于腸道，還可能對大腦、肝臟這樣的器官產(chǎn)生影響，相反的，人體對腸道微生物也有影響。因此，未來我們或許可以通過調(diào)節(jié)腸道微生物菌群，對我們來管理我們的身體狀態(tài)。
　　近期發(fā)表在《Trends in Microbiology》的綜述文章，具體討論了從食物來源進入腸道的益生菌群體（主要是雙歧桿菌、乳酸菌和丙酸桿菌）是如何影響腸道原有的微生物群體的。從食物中進入人體的這三種微生物類群是常用在食品發(fā)酵工業(yè)中的微生物，從數(shù)量上來說，在腸道中占據(jù)著很大比例。
　　作者們分析了很多的臨床數(shù)據(jù)，綜述了一些研究文章，他們認為這些來自食物的菌群確實影響著腸道微生物群和宿主健康。從食物進入腸道的很多益生菌確實能夠進入小腸，而且躲過了胃里的強酸環(huán)境而仍然頑強的或者，并還有生理活性，可以完成一些分子的合成代謝。這些微生物占據(jù)著正常腸道微生物群體的一部分，并且很多次在腸道微生物群的分析中被檢測出來。
　　實際上，很多研究都表明，通過食物進入人體的這些益生菌，對原有的微生物菌群的組成并沒有太大的影響，但是對某些特定的微生物群體會產(chǎn)生影響。例如，會導(dǎo)致產(chǎn)短鏈脂肪酸菌群增加，從而使得產(chǎn)蛋白菌群數(shù)量減少，這是這些微生物導(dǎo)致碳水化合物代謝變化的一個例子。此外，這些來自食物的微生物也會影響著嬰兒腸道微生物菌群的形成。
　　作者們認為，來自食物的益生菌能夠影響碳水化合物代謝的研究是很激動人心的。例如，這些細菌可以促進短鏈脂肪酸和丁酸鹽的合成增加，而減少蛋白質(zhì)的合成量。已有的證據(jù)表明，蛋白合成量大和丁酸鹽合成量減少是對人體健康不利的。比如會造成腸道系統(tǒng)紊亂和導(dǎo)致二型糖尿病發(fā)病率的增加。
　　這就為這些益生菌為啥會是“益生菌"提供了證據(jù)。其他類型的益生菌代謝物，例如*胺，也被認為與心血管疾病已經(jīng)氨基酸代謝密切關(guān)聯(lián)。
　　合理地選擇研究的微生物類型，并通過臨床研究來確認他們的功能，這或許能夠讓我們研發(fā)新一代的可食用益生菌，幫助我們解決身體困擾。