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標(biāo)準(zhǔn)品
培養(yǎng)基
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暨大生科院用定量化中心法則進行核酸研究

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生物遺傳中心法則于1958年由克里克提出,然而半個世紀(jì)以來,這一過程的定量傳遞關(guān)系一直困擾著科學(xué)界,近日暨南大學(xué)功能蛋白質(zhì)研究廣東普通高校重點實驗室張弓研究員、王通研究員和何慶瑜教授在新研究中建立定量的中心法則,將之前只能定性描述的“中心法則”*次定量化,相關(guān)論文發(fā)表在2013年3月21日的《核酸研究》(Nucleic Acids Research)上。
 
生物學(xué)基本理論之一的“中心法則”于1958年被提出,定性地說明了mRNA通過翻譯過程生成蛋白質(zhì),但隨后55年,這一過程的定量傳遞關(guān)系卻一直困擾著科學(xué)界。數(shù)十年來的研究表明,不同物種中的mRNA豐度和蛋白質(zhì)豐度普遍相關(guān)性較低,R2在0.01-0.50之間。由于某些mRNA分子并不被翻譯,早在2001年,Pradet-Balade等人就提出假說:翻譯中的mRNA(也就是核糖體-新生肽鏈復(fù)合物中的mRNA,RNC-mRNA)的豐度應(yīng)該更能反映蛋白質(zhì)的豐度。然而,隨后有限的研究表明,這種二元相關(guān)性仍然較低,R2在0.4以下。因此,從mRNA到蛋白質(zhì)的定量傳遞關(guān)系一直是中心法則沒有解決的科學(xué)問題。
 
張弓、王通和何慶瑜課題組利用穩(wěn)態(tài)人類細胞進行了相對定量研究,在RNC-mRNA和蛋白質(zhì)相對豐度之間加入mRNA的長度作為獨立的因素,發(fā)現(xiàn)RNC-mRNA和蛋白質(zhì)相對豐度與mRNA的長度之間存在顯著的三元對數(shù)線性相關(guān)定量關(guān)系,R2在0.94以上,亦即超過94%的蛋白質(zhì)的相對豐度可以通過其翻譯中RNC-mRNA的相對量和mRNA長度計算獲得。這一結(jié)果使中心法則中的定量關(guān)系難題在相對定量模型中得到初步解決。
 
同時,該研究提出了翻譯比率的新概念(translation ratio, TR),即能夠進入翻譯的mRNA比例,可由RNC-mRNA與總mRNA的比值獲得,主要表征著翻譯起始的效率。本研究發(fā)現(xiàn),癌癥細胞中各種mRNA的TR普遍比正常細胞上調(diào),而且長度越短的基因具越高的TR,表明更容易被翻譯。同時,具顯著TR改變的基因與肺癌的惡性表型密切相關(guān)。
 
該研究在理論上提出中心法則的系統(tǒng)生物學(xué)相對定量規(guī)律,報道了通過RNC-mRNA預(yù)測蛋白質(zhì)相對豐度變化的新策略,這表明,人類穩(wěn)態(tài)細胞所表達的12000多種蛋白質(zhì)中的絕大部分相對量可通過該研究提出的三元模型計算獲得,實現(xiàn)了用核酸大規(guī)模測序技術(shù)來研究蛋白質(zhì)組相對定量信息的目標(biāo)。同時,TR及其生物學(xué)意義的提出,為癌癥細胞表型研究、分子機制研究和新治療策略提供了全新的研究方向。
 
目前該課題組正在利用定量模型對該理論進行更深入的探究,成果將在近期內(nèi)發(fā)表。
 

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